南宁房屋契税计算方式是九十平方米以下的房屋需要缴纳百分之一的契税，九十到一百四平方米的需要缴纳百分之一点五的契税。房屋契税去房管局缴纳，也可以在办理房产证的时候缴纳即可。
一、南宁房屋契税怎么算
南宁房屋契税计算方式：90平米以下首次购房契税：1%;90到140平米首次购房契税1.5%140平米以上的均为3%。计税的基数从12年7月1日起，变更为房屋的成交价!如果房管局对提交的成交价格有异议，可以申请评估公司出评估报告!如有较大差异，则按评估价格核算税费，但要承担评估费。
二、房屋契税去哪里交
契税和维修基金国家规定是交给房管局；现在契税是办房产证时再交就可以了。
友情提示，如果购买的是新房，凭购房合同原件和复印件、或收据原件和复印件、身份证原件和复印件，就可以办理契税缴纳手续。 如果购买的是二手房，则须提供以下资料方可办理契税缴纳手续：买卖双方到房产交易窗口签订房屋转移纳税申请书；房产评估报告原件和复印件；买卖双方的身份证复印件；原房产证原件和复印件。
三、房产契税退税政策
房产契税退税政策是购房时适用税率错误，经税务窗口工作人员验证通过的可以申请退税；购房合同房屋面积大于房屋产权证面积，凭房屋产权证原件及开发商退款证明可以申请退税；房屋经县级以上人民政府拆迁，享受拆迁优惠的可以申请退税。
法律依据
《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第七十八条
税务机关发现纳税人多缴税款的，应当自发现之日起10日内办理退还手续；纳税人发现多缴税款，要求退还的，税务机关应当自接到纳税人退还申请之日起30日内查实并办理退还手续。
第五十一条规定的加算银行同期存款利息的多缴税款退税，不包括依法预缴税款形成的结算退税、出口退税和各种减免退税。